鄂尔多斯火车站站房建筑总面积30000平方米，属于线侧平式站房，站房室内设两层候车，进站大厅通高。从2019年12月18日起实行高铁和动车组列车的电子客票业务，届时凡购买G和D字头动车组车票的旅客只需刷居民身份证或手机二维码即可进站乘车。