秦巴巴鲵是脊索动物门、两栖纲、有尾目、小鲵科、巴鲵属的动物。犁骨齿列呈二短弧形，内枝略长于外枝，每侧有齿7~10枚；具前颌囟；无唇褶；体侧有肋沟13条；肺短小，后端仅达第二、三肋沟部位；雄鲵头部、体背及四肢背面无小白刺。