鹳形目在鸟类DNA分类系统中是鸟纲中的一个目。Sibley和Monroe根据基因测序的结果提出了鸟类DNA分类系统，对传统的鸟类分类作出重大调整。在新系统中，将传统分类系统中独立存在的潜鸟目、鸊鷉目、隼形目、鸥形目以及鸻形目合并到一个巨大的鹳形目名下，从而形成了一个堪与雀形目比肩的大目。