齐河县国土资源局内设15个科室：办公室、财务科、耕保科、复垦置换办公室、地籍科、信息科、测绘科、地矿科、规划科、土地利用科、监察科、政务大厅、土地整理中心、信访室、土地评估登记代理中心。下设7个国土资源分局：晏城国土资源分局、开发区国土资源分局、赵官国土资源分局、宣章国土资源分局、焦庙国土资源分局、潘店国土资源分局、祝阿国土资源分局。