永嘉县国税局系统负责和主管中央税、中央与地方共享税及国家指定税种的征收管理职能，承担着全县增值税、消费税等主体税种和部分企业所得税、外商投资企业所得税、储蓄存款利息所得个人所得税、金融企业部分营业税的征收任务以及出口退税的管理任务。