据历史记载，百花古寺的前身为莲花书院，于东汉明帝十一年（公元68年）建于南香山（南樵山）内，与佛教传入中国的历史记载十分接近。据《增城志（明版）》记载，“未有增城，先有百花”。增城建县于东汉建安六年（公元201年），而百花书院比建安早130多年，距今已有1900多年历史，莲花书院是增城最早的文化教育圣地。