海口市气象局是2003年5月经海南省机构编制委员会批准成立的正处级事业单位，实行海南省气象局和海口市人民政府双重领导，以海南省气象局领导为主的管理体制。截至2010年11月，设内设机构1个，直属单位3个，编制32人。