Heparin因最初得自肝脏，故名肝素，存在于哺乳动物的许多脏器中，但以肺和肠粘膜的含量最高。药用heparin多自猪肠粘膜和猪、牛肺脏中提得，它是由D-葡糖胺、L-艾杜糖醛酸及D-葡糖醛酸交替组成的粘多糖硫酸酯。普通heparin的分子量为3~30kD，平均分子量约12kD，强酸性，带有的大量负电荷与其抗凝作用有关。