中国医学科学院阜外医院有3个院区，分别位于北京市西城区北礼士路167号、西城区三里河北街甲1号、西城区北礼士路135号16号楼，始建于1956年，是一所集医疗、科研、预防和人才培养于一体的三级专科医院，是北京市医保定点单位。