来宾市水产畜牧兽医局（原柳州地区水产畜牧局）始建于1979年，当时称柳州地区水产局，1981年柳州地区农业局畜牧科划归柳州地区水产局后称柳州地区畜牧水产养殖局，1987年机构改革后称柳州地区畜牧水产局，2001年行政机构改革后称柳州地区水产畜牧局，2002年撤地建市后称来宾市水产畜牧局，是市人民政府常设行政机构。2007年元月，根据（来政发〔2006〕45号）精神，来宾市水产畜牧局更名为来宾市渔牧兽医局，2008年元月，根据来宾市机构编制委员会（来编〔2007〕151号）精神，来宾市渔牧兽医局更名为来宾市水产畜牧兽医局。