2010年9月21日，黄沙村遭受千年一遇特大洪灾后，黄奕文日夜奔忙，带病坚持战斗在抗洪救灾、复产重建的第一线，因劳累过度导致心肌梗塞，倒在工作岗位上，享年49岁。2011年3月，广东省委追授黄奕文同志为“广东省优秀村党支部书记”称号。