分裂期的周期蛋白N端有一段序列与自身降解有关，称降解盒（destruction box)。当MPF活性达到最高时，通过泛素连接酶催化泛素（ubiquitin）与cyclin结合，cyclin随之被26S蛋自的体水解。G1期周期激自也通过类似的途老降解，侧其药须没有降解金，取而代之的是C端有一段PEST序列参与其降解。