手机证书，第三版在安全性方面做了比较大的改善，对在系统中安装运行的第三方软件有更为严格的规定。某些软件涉及手机软硬件安全/个人信息安全等方面的操作被做了特别的限制（比如随手机开机自动启动就是被限制的功能之一）。有的软件安装了会有功能限制，比如：来电通。实际应用中证书和密钥必须同时使用。