中国台湾当局海军总人数38000-56000人，海军陆战队9000人，各型舰船160余艘，各种飞机、直升机110多架，坦克、装甲车1000余辆。中国台湾当局海军由3个海军军区组成。台湾当局海军舰队司令员直接指挥反潜作战司令部（1991年末建立）、两栖部队、2个驱逐舰中队、1个巡逻中队、1个水雷战中队以及1个后勤中队的军事行动。