人芽囊原虫广泛分布于世界各地。该虫是寄生在高等灵长类和人类肠道内可致病的原虫。人芽囊原虫可侵入肠粘膜上皮。临床表现轻重不一,带虫者可高达44.12%。感染重者可有消化道症状,如腹泻、腹胀、厌食、恶心、呕吐,甚至出现发烧寒战等。免疫功能正常的患者多数为自限性。艾滋病患者容易感染人芽囊原虫,而且症状严重,治疗十分困难。